控制系统采用PLC+PC的监控方式，设置一个中心控制室主站与多个PLC控制分站（如加药分站、滤池分站和送水分站等），现场分站之间、现场分站与中心控制室主站之间以及中心控制室内的计算机均通过以太网通讯。现场设备的控制分为手动与自动两种控制方式：手动时PLC监测设备的运行状态；自动时，PLC监控设备的运行。在自动状态下，还具有键控与自控两种控制方式：当处于自控控制方式时，现场分站PLC可以监控设备的运行，而中心控制室只能监测设备的运行状态；当处于监控控制方式时，中心控制室可以监控设备的运行。